基因組Survey

快速,準確,性價比高。

基因組Survey,專業,卓效。

基因組Survey基於小片段文庫的低深度測序數據,通過K-mer分析,從而有效的評估基因組大小、
GC含量、雜合度以及重複序列的含量等信息,是全麵了解某一物種基因組特征的有效方法,
為後續的全基因組de novo測序的組裝策略的製定提供理論依據。

方法優,周期短,準確度高。

基於K-mer分析,可快速確定基因組特征,該方法已廣泛作為評估
基因組特征的一種有效方法。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
通過K-mer分析,預估物種基因組大小,並對物種的雜合,
重複情況進行分析。對物種進行初步組裝,進行GC含量和
外源汙染分析。同時,基於初步組裝的版本,可以進行SS
R標記開發和同源注釋。

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基因組Survey 分析內容
標準分析 基因組大小評估
雜合度評估
重複率評估
初步組裝
GC含量評估
高級分析 SSR標記開發
同源注釋

出色分析,鑄就完美結果。

測序深度為50X,基於小片段數據,通過K-mer分析可以有效評估基因組大小、
GC含量、雜合度以及重複序列含量等信息,除此之外還可以對數據進行初步組裝、
同源注釋以及SSR標記的開發。

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

基因組Survey采用先進的HiSeq 4000測序平台,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著業務的發展,高性能計算平台將會持續更新並擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

諾禾致源已經成功對鳥類、哺乳動物、水產動物、經濟作物、蘭科植物、
中草藥等進行基因組特征評估,結合豐富的項目經驗,專業的項目方案指導和分析流程,
保證快速、準確的評估基因組特征。