16S、18S、ITS等擴增子測序

產品介紹常見問題經典案例結果展示


16S、18S、ITS等擴增子測序

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一步到位檢測環境微生物多樣性

擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。
16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,
通過檢測目標區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
ITS分為兩個區域:ITS1位於真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位於5.8S和28S之間。

讀長長, 周期短, 性價比高。

采用Ion S5 XL測序平台,以半導體測序技術為核心,直接將化學信號轉換成數字信號,
單端測序,無需拚接,平台重複性比Illumina測序平台更好,
SE400/SE600兩種模式,為擴增子測序提供更多的選擇。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
基於目標區域的測序,檢測序列豐度,以充分研究環境微生物多樣性和
群落結構差異性。

高級分析 解決問題
腸型分析 腸道菌準確定位和疾病預測和治療
PICRUSt 預測宏基因組的功能組成
FAPROTAX 預測環境樣本的生物化學循環過程
Tax4fun 腸道、土壤等樣品的功能預測
FunGuild 預測真菌的生態功能
標準分析 解決問題
物種注釋 物種注釋及各物種豐度信息
α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
β-多樣性分析 不同樣本間的微生物群落
及各樣本差異情況
多元統計分析 尋找組間具有顯著差異的物種,
同時可以比較組內差異和組間差異
的大小,判斷分組是否有意義
CCA分析 研究物種組成與環境因子間的關係
環境因子關聯分析
VPA分析

擴增子測序解密環境微生物多樣性

諾禾致源基於多樣性的測序區域選擇,結合研究目的和樣品自身的特點,
靈活製定研究方案,用專業成熟的樣本
製備、建庫以及數據分析流程,客觀還原樣品本身的菌群結構以及豐度。

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

擴增子測序采用先進的Ion S5 XL測序平台,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著業務的發展,高性能計算平台將會持續更新並擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

項目經驗豐富

至2017年12月,諾禾致源諾禾16S樣本數突破220,000例,
包括土壤、水體、糞便、淤泥、發酵物等樣本。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。