16s / 18s / its
目标区域扩增子

高质量的扩增子测序

一步到位检测环境微生物多样性

扩增子测序是对特定长度的pcr产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16s/18s/its等扩增子测序即通过提取环境样品的dna,选择合适的通用引物扩增16s/18s/its的目的区域,
通过检测目的区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16s/18s rdna为编码原/真核生物核糖体小亚基rrna的dna序列。
its分为两个区域:its1位于真核生物rdna序列18s和5.8s之间,its2位于5.8s和28s之间。

读长长, 周期短, 性价比高。

采用目前illumina hiseq最长测序平台,可以满足16s 1~2个高变区的
测序分析。3天内同时完成3,000个16s样本的测序,测序准确度较miseq平台提高10%,
而拼接效率较miseq平台提高25%,以此获得更全面的菌群信息。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
基于目的区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和
群落差异性。

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分析内容 解决问题
物种注释 物种注释及各物种丰度信息
α-多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
及各样本相似情况
多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,
同时可以比较组内差异和组间差异
的大小,判断分组是否有意义
cca分析 研究物种组成及环境因子间的关系
环境因子关联分析

扩增子测序解密环境微生物多样性

诺禾致源基于多样性的测序区域选择,结合研究目的和样品自身的特点,
灵活制定研究方案,用专业成熟的样本
制备、建库以及数据分析流程,客观还原样品本身的菌群结构以及丰度。

悦读高质量测序数据,尽享hpc澎湃动力

扩增子测序采用先进的hiseq 2500测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(high performance computing,hpc)采用dell计算节点和isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

项目经验丰富

至2015年12月,诺禾致源诺禾16s样本数突破100,000例,
包括土壤、水体、粪便、淤泥、发酵物等样本。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。