16S / 18S / ITS
目標區域擴增子

高質量的擴增子測序

一步到位檢測環境微生物多樣性

擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。
16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目的區域,
通過檢測目的區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
ITS分為兩個區域:ITS1位於真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位於5.8S和28S之間。

讀長長, 周期短, 性價比高。

采用目前Illumina HiSeq最長測序平台,可以滿足16S 1~2個高變區的
測序分析。3天內同時完成3,000個16S樣本的測序,測序準確度較MiSeq平台提高10%,
而拚接效率較MiSeq平台提高25%,以此獲得更全麵的菌群信息。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
基於目的區域的測序,檢測序列豐度,以充分研究環境微生物多樣性和
群落差異性。

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分析內容 解決問題
物種注釋 物種注釋及各物種豐度信息
α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
β-多樣性分析 不同樣本間的微生物群落
及各樣本相似情況
多元統計分析 尋找組間具有顯著差異的物種,
同時可以比較組內差異和組間差異
的大小,判斷分組是否有意義
CCA分析 研究物種組成及環境因子間的關係
環境因子關聯分析

擴增子測序解密環境微生物多樣性

諾禾致源基於多樣性的測序區域選擇,結合研究目的和樣品自身的特點,
靈活製定研究方案,用專業成熟的樣本
製備、建庫以及數據分析流程,客觀還原樣品本身的菌群結構以及豐度。

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

擴增子測序采用先進的HiSeq 2500測序平台,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著業務的發展,高性能計算平台將會持續更新並擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

項目經驗豐富

至2015年12月,諾禾致源諾禾16S樣本數突破100,000例,
包括土壤、水體、糞便、淤泥、發酵物等樣本。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。